Ich habe seit einem der letzten MacOS-Updates (jetzt 10.10.8) das Phänomen, dass sich Dateien, die auf dem Schreibtsich liegen, nicht mehr per Doppelklick-Taste öffnen lassen (mit 2 schnellen Einzelklicks allerdings schon) … Vielleicht ist das bei Dir der gleiche Bug? Und hast Du die aktuelle Scrivener-Version installiert (2.8)?